O Museu de Ciências Naturais do CECLIMAR, organizado em uma área de 980m2, conta com um acervo em zoologia e biologia aquática, constituído principalmente por vertebrados taxidermizados, esqueletos de animais marinhos, invertebrados preservados e aquários marinhos e de água doce, onde pode-se observar uma grande diversidade de peixes e invertebrados. O acervo paleontológico é composto por peças fósseis e painéis explicativos, contando o passado da vida no planeta, em nosso País e, especialmente, no Rio Grande do Sul. Há, também, amostras de rochas e minerais.
Localiza-se junto ao CERAM (Centro de Reabilitação de Fauna Marinha e Silvestre).]
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